Mary, a mogorva árva kislány felfedezi nagybátyja házának és kertjének rejtélyét. A titkok kertje - így nevezi az elveszett Édent idéző, varázslatos helyet. Az itt töltött idő, munka és játék ad erőt Mary és kis, beteg barátja testi-lelki gyógyulásához.