Titokzatos tengeri szörny jelenik meg az óceánban, egy azonosíthatatlan állat, mely rettegésben tartja az embereket egész New Yorkban. Nem volt olyan ember, akit ne foglalkoztatott volna: miféle szörny lehet az?
Expedíciót indítottak a Lincoln Ábrahám gőzfregatt vezetésével, fedélzetén Aronnax Péterrel, a tengerfenék tekintélyes ismerőjével, hú társával, Monsieur Conseillel, és a leghíresebb cetvadásszal, Land Neddel, aki cetet nem hagyott még élve. A nagy hajót néhány kisebb gőzös és naszád kísérte.
Az óriás szörnyet – amit narválnak gondoltak – csak hónapokkal később pillantják meg. Üldözik, majd mikor elég közel kerülnek hozzá, az iszonyatos erővel lövell vizet a hajóra, megbénítva azt.
Ned, Aronnax mester és Conseil a tengerbe zuhan. Kilátástalan helyzetükben egy sötét szörny siet segítségükre – az üldözött állat. Bizony nem állat az, hanem egy tengeralattjáró.
A három bátor ember – fogságukban – megismerkedik a különös tenger alatt járó hajóval, annak parancsnokával, a titokzatos NEMO kapitánnyal. Szabadulásukig sok rejtélyes és különleges kalandon mennek keresztül.